Mgr. Michal Benovics, PhD.

VEGA 1/0583/22
Diverzita, fylogenéza a biogeografia helmintov parazitujúcich akvatické a semiakvatické studenokrvné stavovce

APVV DS-FR-22-0006 (ukončený)
Náhľad pod hladinu: štúdium asociácií medzi hostiteľmi, parazitmi a mikrobiómom vo vodnom prostredí

Prednášky:

• Parazitológia 
• Molekulárna ekológia
• Zoológia

Semináre: 

• Molekulárna ekológia
• Molekulárno-genetické metódy v zoologickom výskume

Cvičenia: 

• Parazitológia
• Molekulárna ekológia
• Molekulárno-genetické metódy v zoologickom výskume

• Mikrobiálne spoločenstvá akvatických stavovcov (Bakalárska práca) 
  Microbial communities of aquatic vertebrates
  Anotácia: Symbiotické organizmy, (napríklad mikrobiota) významne ovplyvňujú vývoj, fyziológiu, správanie, ekológiu aj evolúciu svojich hostiteľov. Zohrávajú kľúčovú úlohu pri udržiavaní homeostázy a pri ochrane hostiteľa pred infekciami. Špecificita mikrobiálnych spoločenstiev a ich možné interakcie s hostiteľom a jeho parazitofaunou predstavujú aktuálnu tému vo výskume hostiteľsko-parazitických vzťahov. Tieto súvislosti sú obzvlášť zaujímavé u akvatických stavovcov, kde na mikrobiotu aj parazity pôsobí celý rad environmentálnych faktorov, ako sú kvalita vody či zmeny v ekosystéme. Záverečné práce v tomto výskumnom okruhu majú za cieľ zhrnutie diverzity a štruktúry mikrobioty u vybraných skupín rýb alebo obojživelníkov. Cieľom je predovšetkým pochopenie ekologického a evolučného významu interakcií medzi mikrobiotou a parazitofaunou. V rámci práce sa študent taktiež oboznámi s bioinformatickým spracovaním mikrobiálnych vzoriek z obojživelníkov a rýb a interpretáciou asociovaných spoločenstiev.
  
  
• Biologické invázie z pohľadu parazitov (Bakalárska/diplomová práca)
  Biological invasions from a parasite’s point of view
  Anotácia: V posledných desaťročiach spôsobujú veľké problémy invázne druhy živočíchov, ktorých výskyt v nových oblastiach je vo väčšine prípadov dôsledkom ľudskej aktivity. Na Slovensku nájdeme aj rady introdukovaných cicavcov, medzi ktoré sa radí napríklad medvedík čistotný (Procyon lotor), psík medvedíkovitý (Nyctereutes procyonoides) alebo nutria riečna (Myocastor coypus). Tieto živočíchy nepredstavujú hrozbu len priamym vplyvom na domácu faunu a ekosystémy, ale môžu pôsobiť aj ako prenášače parazitov pochádzajúcich z iných geografických oblastí. Takto zavlečené druhy cudzopasníkov predstavujú riziko pre miestne populácie, ktoré na ne nie sú prirodzene adaptované. Cieľom prác viazaných na tento výskum je pripraviť literárnu rešerš zhŕňajúcu poznatky o parazitofaune nepôvodných šeliem v Európe a zhodnotiť invázny potenciál jednotlivých parazitických druhov. V praktickej časti sa študent zoznámi s pitvou a zberom parazitologického materiálu a za použitia integrovaného prístupu sa pokúsi nazbierané cudzopasníky identifikovať. Výsledky prác napomôžu pochopeniu rizík spojených s inváznymi živočíchmi na našom území a to predovšetkým tých spojených s parazitmi so zoonotickým potenciálom.
  
  
• Parazity obojživelníkov a ich evolučné vzťahy s hostiteľmi (Bakalárska/diplomová práca)
  Parasites of amphibians and evolutionary relationships with their hosts
  Anotácia: V posledných rokoch bol zaznamenaný narastajúci úbytok obojživelníkov po celom svete, čo upriamuje pozornosť na štúdium potenciálne škodlivých faktorov ohrozujúcich ich spoločenstvá. Jedným z takých faktorov sú aj parazity, ktoré vo veľkej miere vplývajú na organizmus hostiteľa rôznymi spôsobmi – znižujú jeho fitnes, môžu ovplyvňovať jeho správanie, alebo v extrémnych prípadoch môžu spôsobiť až hostiteľovu smrť. Obojživelníky sú bežne parazitované enormným množstvom parazitov, z ktorých práve helminty sú len málo preskúmané. Tie môžu parazitovať nie len v pľúcach, srdci a tráviacom trakte, ale aj v podkožnom priestore a v brušnej dutine obojživelníkov. Cieľom prác napojených na tento výskum je získať nové informácie o diverzite parazitov obojživelníkov za použitia aktuálnych morfologických a molekulárnych metód. Rekonštrukcie evolučnej minulosti parazitov a poznatky o ich diverzite napomôžu pri štúdiu diverzifikácie obojživelníkov samých.
  
  
• Populačno-genetické štúdie parazitov pre mapovanie disperzie hostiteľov (Diplomová práca)
  Utility of parasites in population-genetic studies
  Anotácia: Disperzný potenciál parazitov je úzko spätý s disperznými kapacitami ich hostiteľov. Čím viac medzihostiteľov pre svoj vývoj parazit využíva, tým si zvyšuje pravdepodobnosť rozmnožiť sa a ďalej rozšíriť do prostredia. V populačno-genetických štúdiách boli doposiaľ parazity využívané len veľmi okrajovo, avšak ich potenciál je zrejmý, ako pri odhaľovaní migračných ciest, tak i štúdiu historických expanzných vzorcov ich hostiteľov. Cieľom prác v rámci tohto výskumného balíka je zhrnutie doterajších poznatkov o aplikácií parazitov v populačno-genetických štúdiách a to predovšetkým s využitím klasických populačno-genetických markerov (t.j., vysoko variabilné úseky DNA, mikrosatelity, ddRAD, celogenómové sekvenovanie). Tie poslúžia ako podklad pre vlastnú prácu, kde bude skúmaná populačno-genetická štruktúra vybraných parazitov a faktory, ktoré na ňu vplývajú.

          Ostatné témy záverečných prác pracovníkov Katedry zoológie možno nájsť TU.

Nejat F., Benovics M., Šanda R., Vukić J., Kaya C., Tarkan S.A., Šimková A. (2025) The role of the Middle East in the biogeographical dispersal of host-specific parasites: monogeneans and their cyprinoid fish hosts. Journal of Biogeography e70034. doi: 10.1111/jbi.70034

Benovics M., Seidlová L., Papežík P., Seifertová M., Nejat F., Vetešník L., Voříšková K., Šimková A. (2025) Population genetic structure of Dactylogyrus vistulae, a gill parasite of cyprinoid fish in the Western Palearctic. International Journal for Parasitology 55: 525-536. doi: 10.1016/j.ijpara.2025.04.010

Koutná K., Benovics M., Scholz T. (2025) The diversity of Khawia tapeworms (Cestoda: Caryophyllidea) of barbels (Cyprinidae: Barbinae) in the western Palearctic: the existence of vicariant lineages and the description of a new species from the Iberian Peninsula. Parasitology 152: 618-631. doi: 10.1017/S0031182025100206

Strachinis I., Mikulíček P., Javorčík A., Benovics M., Papežík P. (2025) A new diagnostic character to distinguish the Epirus Waterfrog, Pelophylax epeiroticus (Schneider, Sofianidou & Kyriakopoulou-Sklavounou, 1984), from the syntopic Balkan Frog, Pelophylax ridibundus kurtmuelleri (Gayda, 1940). Herpetology Notes 18: 329-333. LINK

De Chambrier A., Kuchta R., Kyslík J., Benovics M., Scholz T. (2025) The North American tapeworm Ophiotaenia saphena (Cestoda: Proteocephalidae) in frogs (Ranidae) of Europe: introduction via the American bullfrog (Lithobates catesbeianus)? Systematics and Biodiversity 23: 2435831. doi: 10.1080/14772000.2024.2435831

Gulyás K., Balogová M., Pipová N., Papežík P., Uhrovič D., Mikulíček P., Brázová T., Benovics M. (2025) Insights into the genetic diversity and species distribution of Oswaldocruzia nematodes (Trichostrongylida: Molineidae) in Europe: apparent absence of geographic and population structuring in amphibians. Parasite 32: 27. doi: 10.1051/parasite/2025020

Benovics M., Šimková A., Papežík P., Křížová K.C., Ondračková M., Zach M., Seifertová M. (2025) Novel molecular data for diplozoids reveal similar mitochondrial and ribosomal phylogenies, unexpected geographical structure, and intra-individual mito-nuclear incompatibilities. Zoological Journal of the Linnean Society 203: zlaf021. doi: 10.1093/zoolinnean/zlaf021

Papežík P., Aschengeschwandtnerová S., Benovics M., Dedukh D., Doležálková-Kaštánková M., Choleva L., Javorčík A., Lymberakis P., Papežíková S., Poulakakis N., Sari I., Šanda R., Vukić J., Mikulíček P. (2025) A pattern of hybridisation and population genetic structure of two water frog species (Ranidae, Amphibia) in the southwestern Balkans. Zoological Scripta. doi: 10.1111/zsc.12723

Marková A., Orosová M., Mora P., Benovics M., Lorite P. (2025) The first insight into Acanthocephalus (Palaeacanthocephala) satellitome: species-specific satellites as potential cytogenetic markers. Scientific Reports 15: 2945. doi: 10.1038/s41598-025-85728-2

Benovics M., Nosková E., Klimešová A., Škorpíková L., Jaššová E., Drimaj J., Slováček J., Mikulka O. (2024) Helminth diversity of nutria (Myocastor coypus) across the Morava basin in the Czech Republic. Parasitology. doi: 10.1017/S0031182024001628

Papežík P, Sciberras A, Benovics M, Sciberras J, Deidun A, Mikulíček P (2024) Far from home: tracing the origin of non‑native water frogs (genus Pelophylax) in Malta by molecular markers. Biological Invasions 26: 1045-1059. doi: 10.21203/rs.3.rs-2985502/v1

Benovics M., Rahmouni C., Řehulková E., Nejat F., Šimková A. (2024) Uncovering the monogenean species diversity of cyprinoid fish in Iraq using an integrative approach. Parasitology 151: 220-246. doi: 10.1017/S0031182023001348

Rahmouni C., Seifertová M., Benovics M., Šimková A (2023) Diversity and phylogeny of Gyrodactylus spp. (Monogenea: Gyrodactylidae) across the Strait of Gibraltar: parasite speciation and historical biogeography of west Mediterranean cyprinid Hosts. Diversity 15: 1152. doi: /10.3390/d15111152

Molokomme P.S., Benovics M., Luus-Powell W.J., Lukhele L.P., Přikrylová I. (2023) Dactylogyrus spp. (Dactylogyridae, Monogenea) from tinfoil barb, Barbonymus schwanenfeldii imported into South Africa: morphometric and molecular characterization. Parasite 30: 29. 10.1051/parasite/2023031

Ehlers L.P., Slaviero M., De Lorenzo C., Fagundes-Moreira R., de Souza V.K., Perles L., Baggio-Souza V., Bezerra-Santos M.A., Modrý D., Benovics M., Panziera W., Driemeier D., Pavarini S.P., Soares J.F., Otranto D., Sonne L. (2023) Pathological findings associated with Dipetalonema spp. (Spirurida: Onchocercidae) infection in two species of Neotropical monkeys from Brazil. Parasitology Research 122: 1973-1982. doi: 10.1007/s00436-023-07895-3

Papežík P., Mikulíček P., Benovics M., Balogová M., Choleva L., Doležálková-Kaštánková M., Lymberakis P., Miszei E., Papežíková S., Poulakakis N., Sacdanaku E., Szabolcs M., Šanda R., Uhrín M., Vukić J., Jablonski D. 2023. Comparative mitochondrial phylogeography of water frogs (Ranidae: Pelophylax spp.) from the southwestern Balkans. Vertebrate Zoology 73: 525-544. doi: 10.3897/vz.73.e95220

Nejat F., Benovics M., Řehulková E., Vukić J., Šanda R., Kaya C., Tarkan S.A., Abdoli A., Aksu S., Šimková A. (2023) Diversity, phylogeny and intraspecific variability of Paradiplozoon species (Monogenea: Diplozoidae) parasitizing endemic cyprinoids in the Middle East. Parasitology 150: 705-722. doi: 10.1017/S0031182023000446

Benovics M., Vukić J., Šanda R., Nejat F., Charmpila E.A., Buj I., Shumka S., Porcelloti S., Tarkan S.A., Aksu S., Emiroğlu O., Šimková A. (2023) Monogeneans and chubs: ancient host-parasite system under the looking glass. Molecular Phylogenetics and Evolution 179: 107667. doi: 10.1016/j.ympev.2022.107667

Seidlová L., Benovics M., Šimková A. (2022) Gill monogeneans of neotropical cichlid fish: diversity, phylogenetic relationships, and host-parasite cophylogenetic associations. International Journal for Parasitology 52: 603–615. doi: 10.1016/j.ijpara.2022.05.001

Benovics M., Mikulíček P., Žákovicová Z., Papežík P., Pantoja C. (2022) Hidden in plain sight: novel molecular data reveal unexpected genetic diversity among paramphistome parasites (Digenea: Paramphistomoidea) of European water frogs. Parasitology 149: 1425–1438. doi: 10.1017/S003118202200083X

Benovics M., Reslová N., Škorpíkova L., Seidlová L., Mikulka O. (2022) Helminth fauna of the Eurasian beaver in the Czech Republic with remarks on the genetic diversity of specialist Stichorchis subtriquetrus (Digenea: Cladorchiidae). Parasitology Research 121: 633–644. doi: 10.1007/s00436-021-07379-2

Benovics M., Nejat F., Abdoli A., Šimková A. (2021) Molecular and morphological phylogeny of host-specific Dactylogyrus parasites (Monogenea) sheds new light on the puzzling Middle Eastern origin of European and African lineages. Parasites & Vectors 14: 372. doi: 10.1186/s13071-021-04863-7

Benovics M., Gettová L., Šimková A. (2021) De novo developed microsatellite markers in gill parasites of the genus Dactylogyrus (Monogenea): Revealing the phylogeographical pattern of population structure in the generalist parasite Dactylogyrus vistulae. Ecology and Evolution 11: 16585–16599. doi: 10.1002/ece3.8230

Mikulíček P., Mešková M., Cyprich M., Jablonski D., Papežík P., Hamidi D., Akın Pekşen C., Vörös J., Herczeg D., Benovics M. (2021) Weak population-genetic structure of widely distributed nematode parasite of frogs in the western Palearctic. Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research 59: 1698–1702. doi: 10.1111/jzs.12575

Papežík P., Kubala P., Jablonski D., Doležálková-Kaštánková M., Choleva L., Benovics M., Mikulíček P. (2021) Morphological differentiation of endemic water frogs (Ranidae: Pelophylax) from the southwestern Balkans. Salamandra 57: 105–123. LINK

Benovics M., Koubková B., Civáňová K., Rahmouni I., Čermáková K., Šimková A. (2021) Diversity and phylogeny of Paradiplozoon species (Monogenea: Diplozoidae) parasitising endemic cyprinoids in the peri-Mediterranean area, with a description of three new Paradiplozoon species. Parasitology Research 120: 481–496. doi: 10.1007/s00436-020-06982-z

Benovics M., Francová K., Volta P., Dlapka V., Šimková A. (2021) Helminth communities of endemic cyprinoids of the Apennine Peninsula, with remarks on ectoparasitic monogeneans, and a description of four new Dactylogyrus Diesing, 1858 species. Parasitology 148: 1003–1018. doi: 10.1017/S0031182021000615

Benovics M., Vukić J., Šanda R., Rahmouni I., Šimková A. (2020) Disentangling the evolutionary history of peri-Mediterranean cyprinids using host-specific gill monogeneans. International Journal for Parasitology 50: 969–984. doi: 10.1016/j.ijpara.2020.05.007

Řehulková E., Benovics M., Šimková A. (2020) Uncovering the diversity of monogeneans (Platyhelminthes) on endemic cypriniform fishes of the Balkan Peninsula: new species of Dactylogyrus and comments on their phylogeny and host-parasite associations in a biogeographic context. Parasite 27: 66. doi: 10.1051/parasite/2020059

Jablonski D., Benovics M., Vorel J., Mohammed S.I., Afrasiab S.R. (2020) The first record of the genus Microgecko Nikolskii, 1907 for Iraq. Herpetozoa 33: 149-155. doi: 10.3897/herpetozoa.33.e52736

Benovics M., Desdevises Y., Šanda R., Vukić J., Scheifler M., Doadrio I., Sousa-Santos C., Šimková A. (2020) High diversity of fish ectoparasitic monogeneans (Dactylogyrus) in the Iberian Peninsula: a case of adaptive radiation? Parasitology 147: 418–430. doi: 10.1017/S0031182020000050

Benovics M., Desdevises Y., Šanda R., Vukić J., Šimková A. (2020) Cophylogenetic relationships between Dactylogyrus (Monogenea) ectoparasites and endemic cyprinoids of the north-eastern European peri-Mediterranean region. Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research 58: 1–21. doi: 10.1111/jzs.12341

Benovics M., Desdevises Y., Vukić J., Šanda R. Šimková A. (2018) The phylogenetic relationships and species richness of host-specific Dactylogyrus parasites shaped by the biogeography of Balkan cyprinids. Scientific Reports 8: 13006. doi: 10.1038/s41598-018-31382-w

Roudnický P., Vorel J., Ilgová J., Benovics M., Norek A., Jedličková L., Mikeš L., Potěšil D., Zdráhal Z., Dvořák J., Gelnar M., Kašný M. (2018) Identification and partial characterization of a novel serpin from Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Polyopisthocotylea). Parasite 25: 61. doi: 10.1051/parasite/2018062

Benovics M., Kičinjaová M. L., Šimková A. (2017) The phylogenetic position of the enigmatic Balkan Aulopyge huegelii (Teleostei: Cyprinidae) from the perspective of host-specific Dactylogyrus parasites (Monogenea), with a description of Dactylogyrus omenti n. sp. Parasites & Vectors 10: 547. doi: 10.1186/s13071-017-2491-z

Herczeg D., Vörös J., Christiansen D., Benovics M., Mikulíček P. (2017) Taxonomic composition and ploidy level among European water frogs (Anura: Ranidae: Pelophylax) in eastern Hungary. Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research 55: 129–137. doi: 10.1111/jzs.12158

Ilgová J., Jedličková L., Dvořáková H., Benovics M., Mikeš L., Janda L., Vorel J., Roudnický P., Potěšil D., Zdráhal Z., Gelnar M., Kašný M. (2017) A novel type I cystatin of parasite origin with atypical legumain-binding domain. Scientific Reports 7: 17526. doi: 10.1038/s41598-017-17598-2

Šimková A., Benovics M., Rahmouni I., Vukić J. (2017) Host-specific Dactylogyrus parasites revealing new insights on the historical biogeography of Northwest African and Iberian cyprinid fish. Parasites & Vectors 10: 589. doi: 10.1186/s13071-017-2521-x