Výzvy na Postdoktorandské pobyty UK

Ponuka pozícií na obsadenie miest postdoktorandských pobytov na PRIF UK UK v rámci výzvy Postdoktorandské pobyty na Univerzite Komenského v Bratislave 2025-2026

Projekt: Zahrnutie konformačnej flexibility do AI/ML modelov určených na predikciu afinity ligand – proteín

Hlavným cieľom projeku je rozšírenie existujúcich AI/ML modelov určených na predikciu afinity proteín-ligand o relevantné informácie vyplývajúce z konformačnej flexibility ligandov. Tento smer potenciálneho zlepšenia ich presnosti a spoľahlivosti nebude v rámci projektu exkluzívny, budú študované aj iné možnosti a prístupy smerujúce k vytýčenému cieľu, pričom dôraz bude kladený na minimalizáciu výpočtových nárokov implementovaných postupov.

Vedúci projektu (garant): doc. Mgr. Michal Pitoňák PhD., michal.pitonakuniba.sk

Požadovaná kvalifikácia a skúsenosti:

Nutné:

skúsenosť s počítačovou implementáciou AI/ML pracovných postupov,
výborná znalosť jazyka Python a najpoužívaných knižníc a “frameworkov” v tomto jazyku pre spracovanie dát (Numpy, Pandas, PyTorch, atď),
primeraná orientácia v štatistickej analýze a matematických základoch najbežnejších ML metód (hlboké neurónové siete, autoenkódery, transformery, grafové neurónové siete a pod.),
skúsenosť s modelovaním molekúl a prehľad v oblasti molekulových deskriptorov.

Žiaduce:

skúsenosti s modelovaním biomolekúl, molekulovým dokovaním, simuláciami metódami molekulovej dynamiky, prácou na High-Performance Computing (HPC) systémoch (a operačných systémov na báze UNIXu / Linuxu), a (paralelným) programovaním v jazykoch C/C++/Fortran alebo RUST.

Projekt: Vývoj syntézy chirálnych oligoarylových zlúčenín prostredníctvom regio- a atroposelektívnych C–H arylácií

Projekt zahŕňa zahŕňať vývoj syntézy chirálnych oligoarylových zlúčenín prostredníctvom regio- a atroposelektívnych C-H arylácií. Cieľom je sprístupniť novú triedu chirálnych molekulárnych fluorescenčných materiálov s potenciálnym využitím v optoelektronike s použitím environmentálne udržateľných syntetických metód

Vedúci projektu (garant): doc. RNDr. Martin Putala, CSc., martin.putalauniba.sk

Požadovaná kvalifikácia a skúsenosti:

Nedávno ukončené PhD. v syntetickej organickej chémii (ukončené v rokoch 2022 až 2025)
Silná kompetencia v syntetickej organickej chémii a analytických technikách
Kreativita v písaní a schopnosť pracovať s vysokou mierou samostatnosti
Nadšenie pre výskum, záujem o vývoj syntetických metód a vývoj funkčných organických materiálov
Skúsenosti s vývojom syntetických organických metód (napr. stereoselektívna syntéza, katalýza komplexami prechodných kovov)
Vítané sú skúsenosti v oblasti molekulového modelovania DFT metódou
Výsledky vo vysoko kvalitných vedeckých publikáciách a grantoch
Veľmi dobrá znalosť anglického jazyka. Vynikajúce písomné a ústne komunikačné schopnosti

Projekt: Využitie hydroprimingu semien na obnovu životného prostredia so zameraním na reprodukciu rastlinných druhov

Mnohé rastlinné druhy majú problémy s reprodukčným rozmnožovaním. Preto je potrebné študovať možnosti stimulácie semien pre rýchlejší a kvalitnejší rast budúcich sadeníc. To sa dá dosiahnuť stimuláciou semien hydroprimingom.

Vedúci projektu (garant): doc. RNDr. Božena Šerá, Ph.D., bozena.serauniba.sk

Požadovaná kvalifikácia a skúsenosti:

Pre tieto pozície neexistuje žiadne geografické obmedzenie. Uchádzači musia mať titul PhD. (alebo ekvivalent), ktorý získali menej ako tri roky pred očakávaným dátumom nástupu do funkcie. Uchádzač nesmie presiahnuť 35 rokov. Držitelia titulu PhD. z Univerzity Komenského v Bratislave nie sú oprávnení. Vedecké skúsenosti s ekológiou a biológiou semena sú výhodné.